17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3029 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  45.59 
 
 		 650 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  40.13 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  42.07 
 
 		 456 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  42.23 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1168 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  28.96 
 
 		 781 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  36.61 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  32.86 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  26.48 
 
 		 461 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  26.49 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  31.58 
 
 		 777 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  32.69 
 
 		 843 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  32.91 
 
 		 562 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  34.57 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1817  hypothetical protein  38.03 
 
 		 532 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0270492  hitchhiker  0.00149176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>