26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5053 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1075    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  36.88 
 
 
515 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4924  hypothetical protein  35.74 
 
 
513 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.967117  normal  0.381543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5318  hypothetical protein  38.75 
 
 
585 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0716  hypothetical protein  38.18 
 
 
338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112305  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  28.33 
 
 
1037 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  28.61 
 
 
689 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  31.52 
 
 
781 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  31.93 
 
 
1168 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08391  hypothetical protein  31.01 
 
 
353 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  28.11 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1112  hypothetical protein  37.78 
 
 
735 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210473 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1122 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1090 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1122 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1122 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1090 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1090 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  36.84 
 
 
1074 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  33.2 
 
 
918 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.65 
 
 
2095 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5215  hypothetical protein  32.47 
 
 
173 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  31.68 
 
 
861 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  26.17 
 
 
1258 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  30.4 
 
 
582 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  31.78 
 
 
899 aa  43.9  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>