16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5468 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1075    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  51.88 
 
 		 599 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  56.2 
 
 		 1101 aa  363  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  55.3 
 
 		 953 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  44.89 
 
 		 538 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  57.97 
 
 		 496 aa  87  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  45 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  50.6 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3431  hypothetical protein  48.72 
 
 		 557 aa  70.5  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  45.59 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3503  hypothetical protein  33.09 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00183047  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00635  hypothetical protein  31.85 
 
 		 273 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1168 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6203  hypothetical protein  44.26 
 
 		 203 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.625177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00605  hypothetical protein  36.05 
 
 		 495 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00620  hypothetical protein  33.03 
 
 		 493 aa  43.9  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>