15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00620 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00620  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  984    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00605  hypothetical protein  58.48 
 
 
495 aa  540  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03075  hypothetical protein  31.95 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.433161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03080  hypothetical protein  27.67 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.947585  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00610  hypothetical protein  43.59 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  42.5 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00630  hypothetical protein  30.4 
 
 
277 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00635  hypothetical protein  32.73 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05505  lysyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0927003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03070  hypothetical protein  29.5 
 
 
276 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  42.5 
 
 
275 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  42.55 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  31.33 
 
 
496 aa  47  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02580  hypothetical protein  32.67 
 
 
247 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  33.03 
 
 
546 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.60679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>