27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5662 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2505  Collagen triple helix repeat protein  58.82 
 
 
333 aa  171  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.987301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0887  Collagen triple helix repeat protein  46.67 
 
 
566 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  65.85 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  58.23 
 
 
599 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2258  triple helix repeat-containing collagen  44.91 
 
 
433 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2407  exosporium protein H  46.71 
 
 
435 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  45.51 
 
 
437 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2486  hypothetical protein  46.71 
 
 
428 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000351815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  45.51 
 
 
428 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2924  exosporium protein  44.31 
 
 
450 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  48.67 
 
 
342 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2546  exosporium protein H  45.51 
 
 
421 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  47.06 
 
 
546 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  41.07 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  40.48 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  40.48 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  51.43 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00605  hypothetical protein  39.36 
 
 
495 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00630  hypothetical protein  39.36 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  44.62 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00610  hypothetical protein  46.58 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00635  hypothetical protein  28.64 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00620  hypothetical protein  40.78 
 
 
493 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02580  hypothetical protein  40.43 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  41.07 
 
 
1168 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05505  lysyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0927003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>