13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02580 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02580  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05505  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
293 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0927003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00630  hypothetical protein  40.2 
 
 
277 aa  62  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00610  hypothetical protein  40.48 
 
 
276 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00635  hypothetical protein  32.81 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00605  hypothetical protein  35.4 
 
 
495 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  28.98 
 
 
1168 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  42.5 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  38 
 
 
599 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00620  hypothetical protein  32.67 
 
 
493 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  31.31 
 
 
546 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09858  putative YapH protein  34.62 
 
 
463 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  33.72 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>