15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5661 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  66.23 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  53.41 
 
 
599 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  43.8 
 
 
546 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  45.33 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00635  hypothetical protein  34.57 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00605  hypothetical protein  34.65 
 
 
495 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  39.25 
 
 
328 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  35.48 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00620  hypothetical protein  38.83 
 
 
493 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00610  hypothetical protein  39.73 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  44.23 
 
 
1168 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00630  hypothetical protein  34.07 
 
 
277 aa  48.5  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02580  hypothetical protein  33.71 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05505  lysyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0927003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>