128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0879 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
328 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  46.71 
 
 
309 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  55.22 
 
 
342 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  38.87 
 
 
712 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4499  Collagen triple helix repeat protein  46.9 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0524945  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.05 
 
 
689 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.91 
 
 
2914 aa  83.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  45.6 
 
 
2851 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.38 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  35.62 
 
 
585 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  53.7 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  55 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  36.81 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.85 
 
 
582 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  49.59 
 
 
643 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  51.75 
 
 
706 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  54.17 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  54.17 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  53.33 
 
 
645 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  45.71 
 
 
1101 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  36.93 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  49.49 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  53.76 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  34.16 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  48.7 
 
 
813 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  44.53 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  46.3 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  51.46 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.35 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  52.08 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  49.5 
 
 
466 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  51.02 
 
 
451 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  45.6 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  53.04 
 
 
748 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  47.06 
 
 
523 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  61.43 
 
 
1426 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  33.5 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.62 
 
 
587 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  50.96 
 
 
842 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.29 
 
 
1168 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  42.68 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  51.33 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
542 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  46.36 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  43.7 
 
 
835 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.79 
 
 
936 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  45.9 
 
 
459 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  36.9 
 
 
815 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  37.43 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
1451 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  37.63 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  42.11 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.71 
 
 
582 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  56 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  39.44 
 
 
835 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  42.98 
 
 
647 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  48.48 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  47.62 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  38.68 
 
 
717 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  46.67 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  44.29 
 
 
606 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  44.54 
 
 
492 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  52.38 
 
 
1580 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  32.96 
 
 
474 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  52.04 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  45.54 
 
 
838 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  49.52 
 
 
1147 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  40.65 
 
 
493 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  45.3 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  44.86 
 
 
1219 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  46.3 
 
 
1055 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  49.06 
 
 
1297 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  47.71 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  54.29 
 
 
644 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  41.96 
 
 
524 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  46.09 
 
 
835 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  38.52 
 
 
274 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  39.25 
 
 
249 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  41.67 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  49.06 
 
 
934 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  49.46 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.3 
 
 
835 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  49.06 
 
 
951 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  45.54 
 
 
767 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  50.42 
 
 
1873 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.51 
 
 
867 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  44.33 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
1321 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  49.06 
 
 
1170 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  34.42 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  46.59 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  60 
 
 
558 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  30.43 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  30.43 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3431  hypothetical protein  48.21 
 
 
557 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  44.55 
 
 
444 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  41.67 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  44.33 
 
 
839 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>