154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1380 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
474 aa  913    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  62.12 
 
 
585 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  62.44 
 
 
712 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  66.13 
 
 
643 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  75.38 
 
 
512 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50.61 
 
 
478 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  48.8 
 
 
481 aa  359  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  67.6 
 
 
436 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  54.37 
 
 
842 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  56.08 
 
 
748 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  57.14 
 
 
706 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  50.48 
 
 
813 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  54.97 
 
 
1168 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  48.93 
 
 
1147 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.84 
 
 
1451 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  49.18 
 
 
936 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1366  hypothetical protein  78.23 
 
 
313 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1477  hypothetical protein  78.23 
 
 
301 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  66.31 
 
 
459 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  64.92 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  63.3 
 
 
1580 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  44.06 
 
 
442 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  54.38 
 
 
835 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  55.35 
 
 
835 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  53.53 
 
 
382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  54.59 
 
 
1297 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  49.57 
 
 
1170 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  48.28 
 
 
951 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  62.23 
 
 
1055 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  51.11 
 
 
300 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  57.73 
 
 
606 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  42.52 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  52.34 
 
 
838 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  50.96 
 
 
1321 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  59.28 
 
 
815 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.28 
 
 
2914 aa  139  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  60.11 
 
 
1219 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.44 
 
 
835 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.95 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  50.96 
 
 
835 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  46.22 
 
 
867 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  62.82 
 
 
348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  41.18 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  46.72 
 
 
934 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  37.32 
 
 
492 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  51.69 
 
 
639 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  46.57 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  50.3 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  44.78 
 
 
322 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  40.41 
 
 
400 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  47.18 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  51.76 
 
 
468 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3762  collagen triple helix repeat protein  44.72 
 
 
293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000348192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  60.14 
 
 
252 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  44.21 
 
 
347 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  44.21 
 
 
347 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  40.18 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.45 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  52.36 
 
 
326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44.16 
 
 
319 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.52 
 
 
493 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  44.22 
 
 
523 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  54.24 
 
 
647 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  40.93 
 
 
542 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  42.93 
 
 
582 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.87 
 
 
444 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  43.6 
 
 
469 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.4 
 
 
1101 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  40.64 
 
 
645 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  42.59 
 
 
2851 aa  98.6  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  42.67 
 
 
274 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  42.26 
 
 
300 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  43.71 
 
 
258 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  49.15 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  49.15 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  38.22 
 
 
298 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  39.8 
 
 
1873 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  48.72 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  41.06 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  53.4 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3260  triple helix repeat-containing collagen  60.38 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.524263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  30.31 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  38.82 
 
 
212 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  46.46 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  32.59 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  52.48 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  52.48 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  37.83 
 
 
240 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  60.71 
 
 
299 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  59.57 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  37.82 
 
 
648 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  51.18 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1759  collagen triple helix repeat protein  42.95 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal  0.788316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  47.17 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  39.18 
 
 
767 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  46.77 
 
 
1148 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  42.42 
 
 
580 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>