143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1694 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  59.3 
 
 		 1055 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 1148 aa  1873    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  58.34 
 
 		 1219 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.36 
 
 		 1168 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  52.9 
 
 		 1580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  64.41 
 
 		 815 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  42.73 
 
 		 1297 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  43.92 
 
 		 1170 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  52.31 
 
 		 1147 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  61.04 
 
 		 936 aa  482  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  48.79 
 
 		 1451 aa  479  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  44.76 
 
 		 1321 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  44.78 
 
 		 842 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  59.54 
 
 		 748 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  46.67 
 
 		 835 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  43.71 
 
 		 951 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  43.14 
 
 		 835 aa  358  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.27 
 
 		 934 aa  353  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  47 
 
 		 835 aa  347  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.75 
 
 		 838 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  30.43 
 
 		 1873 aa  328  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  57.11 
 
 		 706 aa  288  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  66.47 
 
 		 462 aa  272  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  44.25 
 
 		 835 aa  270  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  78.55 
 
 		 459 aa  269  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  55.94 
 
 		 712 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  54.52 
 
 		 813 aa  245  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  68.56 
 
 		 309 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  46.78 
 
 		 512 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  61.56 
 
 		 639 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  45.33 
 
 		 2914 aa  219  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  50.12 
 
 		 867 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  54.88 
 
 		 643 aa  208  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  56.49 
 
 		 647 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  69.14 
 
 		 606 aa  207  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  54.64 
 
 		 524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  68.18 
 
 		 300 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  55.99 
 
 		 585 aa  177  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  59.93 
 
 		 469 aa  171  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  57 
 
 		 426 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  43.65 
 
 		 542 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  73.72 
 
 		 348 aa  146  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  74 
 
 		 326 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  42.24 
 
 		 322 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  45.17 
 
 		 444 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  40.65 
 
 		 442 aa  140  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  42.41 
 
 		 319 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  40.12 
 
 		 645 aa  140  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  40.08 
 
 		 400 aa  135  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  39.72 
 
 		 403 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  71.53 
 
 		 252 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  47.51 
 
 		 582 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  43.81 
 
 		 298 aa  128  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  80.17 
 
 		 380 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  55.15 
 
 		 481 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  55.15 
 
 		 478 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.34 
 
 		 492 aa  119  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  43.57 
 
 		 468 aa  118  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  44.2 
 
 		 466 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  56.71 
 
 		 474 aa  115  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  43.82 
 
 		 347 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  43.82 
 
 		 347 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.26 
 
 		 587 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  49.38 
 
 		 473 aa  111  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 750 aa  109  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  75.93 
 
 		 274 aa  108  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  46.05 
 
 		 582 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  40 
 
 		 382 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  43.93 
 
 		 493 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  39.94 
 
 		 497 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  32.41 
 
 		 767 aa  99  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  25.67 
 
 		 2851 aa  97.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  63.31 
 
 		 300 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  40.29 
 
 		 344 aa  95.1  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  68.63 
 
 		 258 aa  94.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  44.65 
 
 		 1101 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  32.69 
 
 		 648 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  74.16 
 
 		 390 aa  89.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  52.5 
 
 		 523 aa  89  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  83.56 
 
 		 283 aa  88.6  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  46.46 
 
 		 222 aa  88.6  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  75.28 
 
 		 445 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  70.45 
 
 		 299 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  56.59 
 
 		 295 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  73.98 
 
 		 366 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  75.58 
 
 		 285 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  43.36 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  47.29 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  69.51 
 
 		 240 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  38.14 
 
 		 212 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  46.51 
 
 		 437 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.71 
 
 		 689 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  81.69 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  78.18 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  45 
 
 		 717 aa  78.2  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  18.09 
 
 		 1788 aa  77.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  38.04 
 
 		 316 aa  77  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  35.98 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.65 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  51.38 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>