Gene Cphy_1694 details

Gene Information

• Locus tag: Cphy_1694
• ID: 5741525
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Clostridium phytofermentans ISDg
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_010001
• Strand: -
• Start bp: 2078054
• End bp: 2081500
• Gene Length: 3447 bp
• Protein Length: 1148 aa
• Translation table: 11
• GC content: 53%
• IMG OID: 641292794
• Product: triple helix repeat-containing collagen
• Protein accession: YP_001558805
• Protein GI: 160879837

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: 21
• Plasmid unclonability p-value: 1
• Plasmid hitchhiking: No
• Plasmid clonability: normal

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

ATGTCATTTT TTGAAAATTA TAACAAAAGA TATAAACGCG ACTTTGTTTG TGACCGTAAT 
AACGATTGCG AGTGCGATTG TGAACACGAC CGAGATAATG ATTGCGAACA CGATTTTGAT 
TGTAAACACG ACCGCAATTA TGATTACAAG CACGATTACG ATTGTGACGG CTGCGATAAC 
GATTGCGAGT ACGATTGCGA GTACGACCGA GAGTGTGACC GATATAATAA TTGCGAACAC 
AACCGAGAGT GCGACCGCAA TAATTATTGC GAGCGCAATT GTGATTGTGA TTGTGATGAC 
TGCGATTATG ACCGAAATTG TCATTGTAAA CAGTGTTGTT GTCTAACAGG ACCAAAAGGA 
CCAAAAGGAC CAACAGGGGC AACTGGATTA ACAGGCGACA CAGGAGCTAC TGGTCCAACA 
GGTGCTACCG GCCCAACAGG CGACACAGGG ACAACCGGTG CTACCGGTCC AACAGGTGAT 
ACGGGAGCAA TGGGAACTAC TGGTGCAACA GGTACTACCG GATTAACAGG TGACACAGGA 
GCTACTGGTG CAGCAGGTGC CACTGGATTA ACAGGCGACA CAGGTGCAAC AGGTGCTACC 
GGTTCAACAG GTGATACGGG AGCGACGGGT ACTACTGGTG CAACAGGAGC AACCGGATTA 
ACAGGCGACA CAGGTGCTAC TGGTGCTACC GGCCCAACAG GTGATACGGG AGCGACTGGT 
ACTACTGGTG CAACAGGAAC CACCGGATTA ACAGGTGACA CAGGAGCTAC TGGTGCTACT 
GGATTAACAG GTGACACGGG AGCAACAGGT GCTACTGGAT TAACAGGCGA CATAGGAGCT 
ACTGGTGCTA CCGGCCCAAC AGGCGATACA GGGGCAACCG GTACTACAGG TCCAACAGGT 
GATACGGGAG CAACGGGAAC TACTGGTGCA ACAGGTGCTA CTGGATTAAC AGGTGACACG 
GGAGCTACTG GTGCAACCGG TCCAGCAGGT GATACTGGTG CGACGGGTAC TACTGGTGCA 
ACAGGAGCAA CCGGATTAAC AGGTGACACA GGTGCTACAG GTGATACTGG AGCTACTGGA 
GCAACCGGAT TAACAGGTGA CACAGGTGCT ACAGGTGCTA CTGGATTAAC TGGCGACACA 
GGTGCTACAG GTGCTACCGG TCCAACAGGT GATACTGGAG CTACTGGAGC AACCGGTCCA 
ACAGGTGATA CGGGAGCGAC GGGTACTACT GGTGCAACAG GAACCACCGG ATTAACAGGT 
GACACAGGTG CTACAGGTGC TACCGGCCCA ACAGGTGATA CGGGAGCTAC TGGAGCAACC 
GGTCCAACAG GTGATACGGG AGCTACTGGA GCAACCGGTC CAACAGGTGA TACTGGAGCG 
ACGGGTACTA CTGGTGCAAC AGGAGCAACC GGATTAACAG GTGACACAGG AGTTACAGGT 
GCTACCGGCC CAACAGGTGA TACAGGTGAT ACTGGTGCAA CAGGAGCCAC TGGATTAACA 
GGTGACACGG GAGCTACTGG AGCAACCGGT CCAACAGGTG ATACTGGAGC TACTGGTACT 
ACTGGATTAA CAGGCGACAC AGGTGCAACA GGTGCTACCG GTCCAACGGG TGATACTGGA 
GCGACGGGTA CTACTGGTGC AACAGGAGCA ACCGGATTAA CAGGTGACAC AGGAGTTACA 
GGTGCTACCG GCCCAACAGG TGATACGGGA GCTACTGGAG CAACCGGTCC AACGGGTGAT 
ACTGGAGCCA CTGGTACTAC CGGTCCAACA GGTGATACTG GAGCTACTGG TGCAACAGGT 
GCCACTGGAT TAACAGGTGA CACAGGAGCT ACAGGTGTTA CTGGCCCAAC AGGTGATACA 
GGTGATACTG GTGCGACGGG TACTACTGGT GCAACAGGAG CCACTGGATT AACAGGTGAC 
ACGGGAGCTA CTGGAGCAAC CGGTCCAACA GGTGATACTG GAGCTACTGG TACTACTGGA 
TTAACAGGCG ACACAGGTGC AACAGGTGCT ACCGGTCCAA CGGGTGATAC TGGTGCGACG 
GGTACTACTG GTGCAACAGG AGCAACAGGT GACACAGGAG TTACAGGTGC TACCGGCCCA 
ACAGGTGATA CGGGAGCTAC TGGAGCAACC GGTCCAACGG GTGATACTGG AGCCACGGGT 
ACTACTGGTG CAACAGGTGC CACTGGATTA ACAGGTGACA CGGGAGCTAC TGGTGCTACT 
GGATTAACAG GCGACACAGG TGCAACAGGT GCTACCGGTC CAACAGGTGC TACCGGTCCA 
ACAGGTGATA CGGGAGCTAC TGGTGCTACC GGTCCAACAG GTGATACTGG AGCTACTGGT 
GCTACTGGTG CTACTGGTGC AACAGGTGCC ACTGGATTAA CAGGTGACAC AGGTGCTACA 
GGTGTTACTG GCCCAACAGG TGATACTGGT GCGACGGGTA CTACTGGTGC AACAGGTGCC 
ACTGGATTAA CAGGTGACAC GGGAGCTACT GGAGCAACCG GTCCAACAGG TGATACTGGA 
GCGACAGGTA CTACTGGATT AACAGGTGCA ACAGGTGCTA CCGGTCCAAC GGGTGATACT 
GGAGCGACGG GTACTACTGG TGCAACAGGT GCTACCGGAT TAACAGGTGA CACAGGAGTT 
ACAGGTGCTA CCGGCCCAAC AGGTGATACG GGAGCTACTG GAGCTACCGG TCCAACAGGT 
GATACGGGAG CCACGGGTAC TACTGGTGCA ATAGGTGCCA CTGGATTAAC AGGCGACACA 
GGTGCAACAG GTGCTACCGG TCCAACAGGT GATACGGGAG CTACTGGTGC TACCGGTCCA 
ACAGGTGATA CTGGAGCGAC AGGTACTACT GGTGCAACAG GAGCCACTGG ATTAACAGGT 
GACACGGGAG CTACTGGTGC TACTGGTCCT GCAGGTGATA CTGGAGCGAC GGGTACTACT 
GGTGCAACAG GAGCCACTGG ATTAACAGGT GACACGGGAG CTACTGGTGC TACTGGTCCT 
GCAGGTGCTA CTGGAGCTAC TGGAGTATTA AACTTTTCAG ACTTTTTTGC ATTGATGCCT 
CCAGATAATT CAGCAACAGT TGCGCCTGGC ACAGATGTAA GCTTTCCTCA AGATGGACCT 
ACGAGTGGTT TAGCCATTAC CCGTACTGGT CCCAGCTCAT TTAACTTGGC TGCAATTGGC 
ACGTATCAAG TATTGTTTCA AGTCAGTGTA GACGAAGCAG GCCAATTGAT TTTGACGCTT 
GGTGGCTCAG ATTTAGCGTA TACGGTGGCC GGACGAGCAA CAGGCACTTC TCAGATTGTA 
GGTATGGCAC TTGTAACCAC AACAGTCATA AATTCAATAC TCACCGTACG AAATCCGGCA 
GGTAATTCAA CAGCACTAAC TATCACTCCC CTTGCCGGTG GAACAAGACC TGTTTCAGCA 
CATCTTGTTA TCACACAAGT TTCGTAA 

 

Protein sequence

MSFFENYNKR YKRDFVCDRN NDCECDCEHD RDNDCEHDFD CKHDRNYDYK HDYDCDGCDN 
DCEYDCEYDR ECDRYNNCEH NRECDRNNYC ERNCDCDCDD CDYDRNCHCK QCCCLTGPKG 
PKGPTGATGL TGDTGATGPT GATGPTGDTG TTGATGPTGD TGAMGTTGAT GTTGLTGDTG 
ATGAAGATGL TGDTGATGAT GSTGDTGATG TTGATGATGL TGDTGATGAT GPTGDTGATG 
TTGATGTTGL TGDTGATGAT GLTGDTGATG ATGLTGDIGA TGATGPTGDT GATGTTGPTG 
DTGATGTTGA TGATGLTGDT GATGATGPAG DTGATGTTGA TGATGLTGDT GATGDTGATG 
ATGLTGDTGA TGATGLTGDT GATGATGPTG DTGATGATGP TGDTGATGTT GATGTTGLTG 
DTGATGATGP TGDTGATGAT GPTGDTGATG ATGPTGDTGA TGTTGATGAT GLTGDTGVTG 
ATGPTGDTGD TGATGATGLT GDTGATGATG PTGDTGATGT TGLTGDTGAT GATGPTGDTG 
ATGTTGATGA TGLTGDTGVT GATGPTGDTG ATGATGPTGD TGATGTTGPT GDTGATGATG 
ATGLTGDTGA TGVTGPTGDT GDTGATGTTG ATGATGLTGD TGATGATGPT GDTGATGTTG 
LTGDTGATGA TGPTGDTGAT GTTGATGATG DTGVTGATGP TGDTGATGAT GPTGDTGATG 
TTGATGATGL TGDTGATGAT GLTGDTGATG ATGPTGATGP TGDTGATGAT GPTGDTGATG 
ATGATGATGA TGLTGDTGAT GVTGPTGDTG ATGTTGATGA TGLTGDTGAT GATGPTGDTG 
ATGTTGLTGA TGATGPTGDT GATGTTGATG ATGLTGDTGV TGATGPTGDT GATGATGPTG 
DTGATGTTGA IGATGLTGDT GATGATGPTG DTGATGATGP TGDTGATGTT GATGATGLTG 
DTGATGATGP AGDTGATGTT GATGATGLTG DTGATGATGP AGATGATGVL NFSDFFALMP 
PDNSATVAPG TDVSFPQDGP TSGLAITRTG PSSFNLAAIG TYQVLFQVSV DEAGQLILTL 
GGSDLAYTVA GRATGTSQIV GMALVTTTVI NSILTVRNPA GNSTALTITP LAGGTRPVSA 
HLVITQVS