82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1364    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  44.57 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  46.91 
 
 		 788 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  42.22 
 
 		 936 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  38.81 
 
 		 680 aa  211  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  40.43 
 
 		 640 aa  210  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  49.26 
 
 		 918 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  41.82 
 
 		 633 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  51.79 
 
 		 339 aa  177  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  38.06 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  34.25 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  37.85 
 
 		 591 aa  164  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  46.15 
 
 		 355 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  39.39 
 
 		 349 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  49 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  38.89 
 
 		 621 aa  142  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  53.79 
 
 		 350 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  42.98 
 
 		 1079 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  39.02 
 
 		 321 aa  134  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  40.23 
 
 		 654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  50.3 
 
 		 341 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  47.69 
 
 		 374 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  44.18 
 
 		 277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  44.18 
 
 		 277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  44.18 
 
 		 277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  44.28 
 
 		 753 aa  129  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  48.03 
 
 		 274 aa  127  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  40.57 
 
 		 365 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  43.02 
 
 		 285 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  51.42 
 
 		 245 aa  123  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 1131 aa  121  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  44.1 
 
 		 675 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  46.35 
 
 		 305 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  46.39 
 
 		 250 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  36.22 
 
 		 971 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  48.39 
 
 		 227 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  22.22 
 
 		 1219 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  51.09 
 
 		 200 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  43.1 
 
 		 286 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  22.91 
 
 		 1055 aa  87.8  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  40.54 
 
 		 689 aa  81.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  21.23 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.25 
 
 		 985 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 698 aa  73.9  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  27.15 
 
 		 936 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  40.97 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3171  pseudouridine synthase, Rsu  37.5 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.601748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  36.24 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  25.95 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  37.22 
 
 		 1161 aa  60.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  46.34 
 
 		 688 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0910  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.44 
 
 		 704 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  39.22 
 
 		 736 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0008  hypothetical protein  34.58 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0787  pseudouridine synthase  38.89 
 
 		 728 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000926536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1584 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  31.82 
 
 		 2851 aa  55.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1147 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  41.7 
 
 		 621 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  25.25 
 
 		 459 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  39.02 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  27.44 
 
 		 842 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  46.23 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2042  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.67 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  26.12 
 
 		 835 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  28.51 
 
 		 512 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 		 854 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  39.46 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  25.06 
 
 		 748 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2022  pseudouridine synthase, Rsu  38.46 
 
 		 669 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6055  pseudouridine synthase, Rsu  38.46 
 
 		 669 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  23.81 
 
 		 1168 aa  48.5  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  25.97 
 
 		 524 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2550  pseudouridine synthase, Rsu  41.36 
 
 		 680 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0219746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  32.97 
 
 		 582 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3094  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.03 
 
 		 620 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2055  pseudouridine synthase, Rsu  36.76 
 
 		 690 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  30.88 
 
 		 1560 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  25 
 
 		 813 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  24.37 
 
 		 1451 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  35.29 
 
 		 710 aa  44.3  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  23.57 
 
 		 2313 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>