125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4285 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  67.3 
 
 		 839 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  67.32 
 
 		 767 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 648 aa  1177    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4075  hypothetical protein  86.99 
 
 		 137 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1408 aa  155  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  32.99 
 
 		 815 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  36.9 
 
 		 1055 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  35.8 
 
 		 1219 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0244  hypothetical protein  45.14 
 
 		 267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  47.74 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  45.37 
 
 		 2851 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  41.4 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  47.62 
 
 		 322 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  31.22 
 
 		 459 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.74 
 
 		 2914 aa  107  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  40.07 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  42.2 
 
 		 300 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  46.98 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  30.18 
 
 		 462 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  49.72 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  33.6 
 
 		 512 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  36.05 
 
 		 936 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  43.08 
 
 		 582 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  43.07 
 
 		 712 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  36.56 
 
 		 1168 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  42.21 
 
 		 466 aa  98.6  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  30.3 
 
 		 748 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  42.21 
 
 		 813 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  52.07 
 
 		 403 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  44.85 
 
 		 842 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.07 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  40.76 
 
 		 473 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  43.65 
 
 		 585 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  38.29 
 
 		 492 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  42.69 
 
 		 468 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  35.58 
 
 		 706 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.6 
 
 		 587 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  35.65 
 
 		 524 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  44.17 
 
 		 469 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  48.92 
 
 		 307 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  50.31 
 
 		 645 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  41.55 
 
 		 835 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  41.23 
 
 		 835 aa  89  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  35.21 
 
 		 380 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  40.95 
 
 		 643 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  44.17 
 
 		 647 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 1580 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1147 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  38.39 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  57.28 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  35.75 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  38.3 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  53.04 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  41.21 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  44.76 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  41.61 
 
 		 481 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.85 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  42.79 
 
 		 835 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  50.86 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  41 
 
 		 867 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  41.03 
 
 		 835 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  31.86 
 
 		 1451 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  33.73 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  38.07 
 
 		 1101 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1773  hypothetical protein  45.61 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.457956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  35.66 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  35.81 
 
 		 1170 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  42.29 
 
 		 1297 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  40.68 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  53.47 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  53.47 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  53.47 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  45.56 
 
 		 934 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  53.49 
 
 		 212 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  44.44 
 
 		 252 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  38.59 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50.5 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  54.37 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  26.13 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  45.18 
 
 		 951 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  52.29 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4112  hypothetical protein  47.78 
 
 		 314 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  28.74 
 
 		 316 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 1426 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  43.23 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  38.51 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  42.86 
 
 		 2397 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 		 1321 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2235  hypothetical protein  52.24 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  42.34 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  42.34 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  47.96 
 
 		 288 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  41.8 
 
 		 639 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  48.86 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.38 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  43.64 
 
 		 1873 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  40.34 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.76 
 
 		 689 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>