158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3403 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 582 aa  1146    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  56.34 
 
 		 813 aa  163  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  40.81 
 
 		 842 aa  163  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.03 
 
 		 2914 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  52.63 
 
 		 643 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  55.32 
 
 		 1168 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  56.99 
 
 		 585 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  52.99 
 
 		 712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  53.71 
 
 		 748 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  50.21 
 
 		 442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  51.64 
 
 		 706 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  51.89 
 
 		 936 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  56.28 
 
 		 1147 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  55.29 
 
 		 835 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  55.09 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  53.33 
 
 		 478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  37.3 
 
 		 400 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  41.25 
 
 		 1101 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  53.62 
 
 		 835 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  54.01 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  47.27 
 
 		 403 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  48.5 
 
 		 300 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  43.9 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  49.04 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.45 
 
 		 689 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  47.71 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  48.47 
 
 		 1219 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  41.18 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  50.24 
 
 		 838 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  49.78 
 
 		 1451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  40.3 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  51.81 
 
 		 606 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  47.34 
 
 		 815 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  48.76 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  45.54 
 
 		 1055 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  48.77 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.57 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  45.92 
 
 		 542 aa  122  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  52.63 
 
 		 1321 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  50.72 
 
 		 951 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  38.38 
 
 		 319 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  46.76 
 
 		 322 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  49.29 
 
 		 835 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  52.22 
 
 		 1297 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  52.53 
 
 		 934 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  49.3 
 
 		 867 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  50.98 
 
 		 835 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  34.01 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  51.81 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  40.98 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  46.61 
 
 		 1170 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.56 
 
 		 473 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  47.02 
 
 		 2851 aa  110  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  49.38 
 
 		 348 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  42.57 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  49.25 
 
 		 1580 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  39.38 
 
 		 645 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  46.12 
 
 		 582 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  51.68 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  40.07 
 
 		 444 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  43.41 
 
 		 1873 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  46.7 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  43.67 
 
 		 298 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  40.57 
 
 		 439 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  41.14 
 
 		 647 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  47.06 
 
 		 469 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  40.7 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  40.91 
 
 		 274 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  40.46 
 
 		 252 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  42.94 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  52.46 
 
 		 212 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  53.23 
 
 		 347 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  53.23 
 
 		 347 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1408 aa  89.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  40.57 
 
 		 366 aa  90.1  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  60.19 
 
 		 438 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  48.41 
 
 		 380 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50.83 
 
 		 437 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50.83 
 
 		 437 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  59.79 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  49.01 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  60.36 
 
 		 253 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  59.65 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  30.99 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  42.6 
 
 		 767 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  51.43 
 
 		 1426 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  44.95 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  41.05 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  53.57 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  56.82 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  41.34 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  39.52 
 
 		 839 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  46.46 
 
 		 222 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 		 283 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  48.44 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  52.33 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  47.5 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  34.17 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  33.75 
 
 		 316 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  59.42 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>