151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1007 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 445 aa  818    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  88.38 
 
 		 380 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  67.69 
 
 		 1580 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  63.78 
 
 		 606 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0887  Collagen triple helix repeat protein  82.5 
 
 		 566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  53.41 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  51.27 
 
 		 459 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  65.2 
 
 		 300 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  61.61 
 
 		 936 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  64.04 
 
 		 1055 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  66.2 
 
 		 815 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  70.35 
 
 		 1219 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  58.33 
 
 		 639 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  60.21 
 
 		 813 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  46.84 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  48.28 
 
 		 706 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.75 
 
 		 748 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  60.42 
 
 		 712 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  67.59 
 
 		 348 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  43.63 
 
 		 512 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  55.3 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  63.24 
 
 		 1147 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  64.36 
 
 		 1451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  40.83 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  63.19 
 
 		 1168 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  56.28 
 
 		 643 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  66.15 
 
 		 326 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  55.43 
 
 		 842 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  54.89 
 
 		 585 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  62.42 
 
 		 252 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  46.54 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  41.35 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0886  hypothetical protein  53.91 
 
 		 116 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  51.8 
 
 		 647 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  41.99 
 
 		 478 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  46.88 
 
 		 2914 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  50.26 
 
 		 835 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  46.49 
 
 		 867 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  45.5 
 
 		 582 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  43.69 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  43.01 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  48.8 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  42.53 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  45.95 
 
 		 835 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  46.3 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  42.07 
 
 		 347 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  42.07 
 
 		 347 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  47.69 
 
 		 300 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  31.1 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  42.35 
 
 		 319 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  47.55 
 
 		 838 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  39.27 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  51.32 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  39.74 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  49.45 
 
 		 835 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  41.76 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  36.23 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  39.67 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.17 
 
 		 587 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.26 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  52.51 
 
 		 1297 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  45.54 
 
 		 1321 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  46.46 
 
 		 951 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  44.75 
 
 		 835 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  46.23 
 
 		 934 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  40.91 
 
 		 582 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  49.38 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  40.77 
 
 		 1101 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  46.43 
 
 		 1170 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  74.8 
 
 		 285 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  55.86 
 
 		 299 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  41.49 
 
 		 648 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  65.66 
 
 		 258 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  52.55 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  42.41 
 
 		 1873 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  36.81 
 
 		 2851 aa  90.9  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  45.41 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  51.45 
 
 		 295 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  47.2 
 
 		 1148 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.3 
 
 		 344 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  71.7 
 
 		 366 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  51.28 
 
 		 717 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  45.89 
 
 		 316 aa  86.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  57.39 
 
 		 369 aa  86.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  41.24 
 
 		 767 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  53.05 
 
 		 315 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  36.21 
 
 		 839 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  37.33 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  44.29 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  58.76 
 
 		 240 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  74.76 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  46.09 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.36 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  46.71 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  46.09 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  61.27 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  36.67 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  47.71 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.36 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>