202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0895 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.22 
 
 
365 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.29 
 
 
752 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  44.09 
 
 
354 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50.93 
 
 
1667 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  44.55 
 
 
354 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.36 
 
 
354 aa  88.6  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  43.7 
 
 
353 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  41.73 
 
 
192 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.57 
 
 
689 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.34 
 
 
1094 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  38.6 
 
 
606 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  46.36 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  49.5 
 
 
272 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  44.04 
 
 
580 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.39 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  43.48 
 
 
819 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0887  Collagen triple helix repeat protein  35.45 
 
 
566 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  36.36 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  39.64 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.89 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.11 
 
 
953 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  39.45 
 
 
810 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.6 
 
 
601 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  48.24 
 
 
487 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.78 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  40 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  32.37 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0886  hypothetical protein  36 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.88 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  40.74 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.84 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.94 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  43.3 
 
 
1189 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  43.4 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.55 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.04 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.96 
 
 
457 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.21 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1767  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.64 
 
 
433 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.14 
 
 
1067 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  38.18 
 
 
556 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.04 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.51 
 
 
971 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.09 
 
 
1056 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.11 
 
 
479 aa  65.1  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.78 
 
 
974 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
776 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  30.7 
 
 
451 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.73 
 
 
366 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.54 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.71 
 
 
323 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.95 
 
 
310 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.69 
 
 
348 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  41.24 
 
 
313 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.58 
 
 
1189 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.78 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.93 
 
 
2114 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.61 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.96 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.23 
 
 
329 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.04 
 
 
316 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  31.71 
 
 
348 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33 
 
 
821 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.5 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.09 
 
 
451 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.37 
 
 
348 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  29.77 
 
 
335 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.73 
 
 
328 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.09 
 
 
328 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.05 
 
 
348 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  31.19 
 
 
314 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.66 
 
 
332 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.29 
 
 
325 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.98 
 
 
334 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.63 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  45 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  26.29 
 
 
660 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4957  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.13 
 
 
1349 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.68 
 
 
607 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  29.73 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.19 
 
 
517 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.63 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
406 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.31 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.56 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.71 
 
 
314 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.97 
 
 
313 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2448  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 
658 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165811  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.24 
 
 
328 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.56 
 
 
327 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.35 
 
 
329 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  35.04 
 
 
954 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  35.04 
 
 
954 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.09 
 
 
338 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  35.04 
 
 
954 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  32.46 
 
 
329 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  32.67 
 
 
312 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>