131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4578 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
444 aa  803    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  46.56 
 
 
842 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  54.96 
 
 
512 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  49.43 
 
 
1168 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.81 
 
 
936 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  49.67 
 
 
835 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  47.59 
 
 
835 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  50.48 
 
 
643 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  45.86 
 
 
462 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  48.37 
 
 
1147 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  54.15 
 
 
712 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  43.2 
 
 
1219 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.95 
 
 
835 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  44.71 
 
 
813 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  49.83 
 
 
1170 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  44.55 
 
 
1055 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.41 
 
 
748 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  47.73 
 
 
706 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  46.38 
 
 
459 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  49.85 
 
 
1451 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  44.15 
 
 
867 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  42.58 
 
 
934 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.18 
 
 
585 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  40.76 
 
 
815 aa  146  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  39.61 
 
 
838 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  42.24 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  42.01 
 
 
1321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  41.95 
 
 
951 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  45.51 
 
 
2914 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  47.47 
 
 
1297 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  45.32 
 
 
1580 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  41.39 
 
 
835 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  42.02 
 
 
645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  40.99 
 
 
322 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  47.21 
 
 
542 aa  121  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.13 
 
 
319 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50.75 
 
 
582 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  46.93 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  47.64 
 
 
298 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  46.38 
 
 
300 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  47.2 
 
 
382 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  41.94 
 
 
492 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  45.22 
 
 
468 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  44.59 
 
 
466 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  54.97 
 
 
473 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  34.05 
 
 
1873 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  47.48 
 
 
606 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  34.97 
 
 
524 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  44.55 
 
 
400 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  40.96 
 
 
587 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  40.73 
 
 
639 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  36.57 
 
 
1408 aa  97.1  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.12 
 
 
481 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  47.12 
 
 
478 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 
493 aa  93.2  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.97 
 
 
689 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  41.06 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  46.33 
 
 
523 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  41.53 
 
 
582 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  33.33 
 
 
2851 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  43.98 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  36.73 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  41.23 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  42.26 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.11 
 
 
1101 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  41.67 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  38.46 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  42.61 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  42.38 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  44.51 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  40.89 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  46.54 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  39.61 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  51.4 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  56.86 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50.47 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50.47 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  45 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  45 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  44.12 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50.47 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  31.03 
 
 
767 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  39.9 
 
 
253 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50.45 
 
 
274 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  36.28 
 
 
580 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  41.94 
 
 
326 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  43.45 
 
 
380 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  47.01 
 
 
717 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  41.04 
 
 
1426 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  32.95 
 
 
316 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  37.81 
 
 
221 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  37.36 
 
 
288 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  50.51 
 
 
222 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  27.33 
 
 
1788 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  44 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  50.67 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  35.77 
 
 
839 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  48.84 
 
 
300 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  48.98 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  45.28 
 
 
258 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>