110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0623 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  69.28 
 
 		 158 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  46.3 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.87 
 
 		 2851 aa  73.6  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  45.34 
 
 		 442 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  45.89 
 
 		 645 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  42.59 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 748 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  36.84 
 
 		 523 aa  65.5  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  43.75 
 
 		 2914 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  37.76 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  31.36 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  36.41 
 
 		 366 aa  62  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  36.59 
 
 		 838 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2944  hypothetical protein  45.16 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  42.59 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.94 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  40 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  35.93 
 
 		 936 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  36.84 
 
 		 468 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  36.84 
 
 		 466 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  35.9 
 
 		 1168 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1147 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  42.58 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  40.37 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  42.58 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  37.34 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  35.37 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  39.35 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  37.79 
 
 		 951 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  37.84 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  32.93 
 
 		 1055 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  38.89 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  35.5 
 
 		 835 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  37.74 
 
 		 403 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  38.31 
 
 		 842 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  38.89 
 
 		 437 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  38.22 
 
 		 934 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  38.3 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 524 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  36.97 
 
 		 1451 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  37.13 
 
 		 1297 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  33.53 
 
 		 1219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  34.81 
 
 		 815 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  39.35 
 
 		 493 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  44.9 
 
 		 434 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  30.85 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  41.33 
 
 		 1321 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  36.36 
 
 		 835 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  38.71 
 
 		 1170 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  45.07 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  37.28 
 
 		 1101 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  36.67 
 
 		 438 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  37.43 
 
 		 712 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  48.72 
 
 		 644 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  36.26 
 
 		 587 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  33.74 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  60.38 
 
 		 839 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  38.16 
 
 		 585 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  34.81 
 
 		 835 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  38.3 
 
 		 298 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  32.58 
 
 		 426 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  36.73 
 
 		 542 aa  48.5  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  27.93 
 
 		 717 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  57.38 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  62.96 
 
 		 1873 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  34.25 
 
 		 835 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  33.99 
 
 		 459 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  61.9 
 
 		 1426 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  34.76 
 
 		 400 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  34.94 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  33.77 
 
 		 348 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  43.86 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  38.78 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.44 
 
 		 689 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  32.89 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  48.44 
 
 		 283 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  50.85 
 
 		 730 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  54.55 
 
 		 867 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  42.11 
 
 		 580 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  35.95 
 
 		 767 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  31.89 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  39.29 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.37 
 
 		 582 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  36.9 
 
 		 606 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  35.98 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0545  hypothetical protein  39.24 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  57.69 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  55.56 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  52.73 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  51.92 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  52.94 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  44.83 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  33.95 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  33.95 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3237  hypothetical protein  63.89 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 629 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>