132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1848 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  57.53 
 
 		 2851 aa  77  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  43.01 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  43.86 
 
 		 2914 aa  72.4  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  61.97 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.33 
 
 		 689 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  40.18 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  67.92 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  65.52 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  63.33 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  58.33 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  56.25 
 
 		 437 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  69.39 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  56.25 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  59.02 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  33.77 
 
 		 309 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3340  collagen triple helix repeat-containing protein  48.8 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  61.02 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  61.67 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  47.25 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  59.09 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  56.52 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  56.52 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  56.52 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  56.52 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  50 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  56.52 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  55.93 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  56.52 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  56.52 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  58.73 
 
 		 813 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  59.18 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  44.23 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  49.3 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  57.97 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  58.62 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  38.46 
 
 		 842 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  57.14 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  57.14 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  35.29 
 
 		 1426 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  58.62 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  31.74 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  61.02 
 
 		 835 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  36.09 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2459  Collagen triple helix repeat protein  31.52 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  57.63 
 
 		 1101 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  36.91 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  62.5 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  43.9 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  53.85 
 
 		 466 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  53.42 
 
 		 835 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  58.06 
 
 		 1147 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  57.38 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  43.9 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  57.63 
 
 		 748 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  47.69 
 
 		 445 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  55 
 
 		 459 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  56.52 
 
 		 1168 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  54.1 
 
 		 644 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  52.05 
 
 		 835 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  62.5 
 
 		 348 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 		 444 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  50.85 
 
 		 587 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  56.14 
 
 		 428 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  59.02 
 
 		 542 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  56.14 
 
 		 835 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  41.27 
 
 		 717 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 934 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  56.45 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  44.33 
 
 		 953 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  52.46 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  52.38 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  55.74 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  50.85 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  51.47 
 
 		 474 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  50.68 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  37.23 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  58.62 
 
 		 951 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  53.23 
 
 		 437 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  58.33 
 
 		 1321 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  51.67 
 
 		 492 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  47.46 
 
 		 473 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.69 
 
 		 380 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  46.05 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 524 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  55.38 
 
 		 1297 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  59.32 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  56.67 
 
 		 1170 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  52.54 
 
 		 314 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  45.24 
 
 		 606 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4274  collagen-like protein  57.14 
 
 		 327 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  33.09 
 
 		 767 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  53.57 
 
 		 462 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  52.54 
 
 		 435 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5441  Collagen triple helix repeat protein  49.25 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  55.36 
 
 		 558 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  52.46 
 
 		 493 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  33.82 
 
 		 839 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  50.79 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  54.24 
 
 		 639 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>