66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3908 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 629 aa  1256    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  45.77 
 
 		 551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  45.79 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  46.01 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  43.74 
 
 		 600 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  41.82 
 
 		 624 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  45.26 
 
 		 1355 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  43.66 
 
 		 592 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  42.37 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  41.52 
 
 		 624 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  40.12 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  41.22 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  43.44 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  39.38 
 
 		 624 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  39.82 
 
 		 624 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  43.63 
 
 		 635 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  42.64 
 
 		 589 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  42.75 
 
 		 589 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  43.26 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  43.76 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  40.39 
 
 		 624 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  41.25 
 
 		 624 aa  425  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  44.86 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  39.16 
 
 		 627 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  39.53 
 
 		 624 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  41.62 
 
 		 857 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  42.73 
 
 		 1322 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  42.88 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  42.75 
 
 		 600 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.58 
 
 		 774 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  45.33 
 
 		 1587 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  42.63 
 
 		 546 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  38.95 
 
 		 621 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  39.09 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  40.86 
 
 		 576 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  37.1 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  39.82 
 
 		 506 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  35.59 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  35.92 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.52 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.29 
 
 		 2701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.06 
 
 		 1795 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  37.26 
 
 		 2182 aa  257  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  34.09 
 
 		 2796 aa  250  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  44.72 
 
 		 1175 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.05 
 
 		 3977 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.58 
 
 		 2852 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 		 1641 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.66 
 
 		 1641 aa  85.1  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  28.57 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  33.6 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  33.6 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  29.14 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  32.69 
 
 		 776 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  23.83 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  32.52 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  30.95 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  25.93 
 
 		 793 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  36.63 
 
 		 733 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  28.78 
 
 		 723 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  28.78 
 
 		 723 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  30.23 
 
 		 760 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  35.23 
 
 		 732 aa  47.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  35.23 
 
 		 732 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  30.61 
 
 		 719 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  35.16 
 
 		 731 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>