79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1779 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  65.11 
 
 		 624 aa  786    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  65.98 
 
 		 624 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  100 
 
 		 627 aa  1261    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  66.77 
 
 		 624 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  67.04 
 
 		 624 aa  791    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  65.75 
 
 		 624 aa  791    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  67.09 
 
 		 624 aa  793    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  67.25 
 
 		 624 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  65.59 
 
 		 635 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  65.91 
 
 		 624 aa  794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  65.59 
 
 		 624 aa  772    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  42.84 
 
 		 621 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  41.16 
 
 		 622 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 629 aa  439  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  45.05 
 
 		 592 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  46.14 
 
 		 533 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  42.38 
 
 		 600 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  42.88 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  39.58 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  41.33 
 
 		 598 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  42.25 
 
 		 633 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  46.42 
 
 		 1587 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  42.99 
 
 		 857 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  43.26 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  40.29 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  41.15 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  41.18 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  40.97 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.09 
 
 		 774 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  41.92 
 
 		 1355 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  40.97 
 
 		 589 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  40.39 
 
 		 589 aa  360  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  40.11 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  37.85 
 
 		 575 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  41.96 
 
 		 576 aa  346  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  39.54 
 
 		 1322 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.03 
 
 		 501 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  37.79 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.61 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  36.15 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  47.96 
 
 		 1175 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.01 
 
 		 2796 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 		 1795 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.61 
 
 		 2701 aa  250  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  35.33 
 
 		 2182 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.21 
 
 		 3977 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  32.35 
 
 		 2852 aa  109  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  26.96 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 		 1641 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.42 
 
 		 1641 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.13 
 
 		 775 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  46.74 
 
 		 748 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  25.37 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  23.71 
 
 		 733 aa  67  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  33.59 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  24.78 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  32.5 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  24.56 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.36 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  22.66 
 
 		 721 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  23.4 
 
 		 760 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  23.49 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  29.85 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  22.7 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  22.7 
 
 		 754 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  27.54 
 
 		 729 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  27.05 
 
 		 729 aa  56.2  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24.9 
 
 		 732 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  22.95 
 
 		 719 aa  54.3  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.51 
 
 		 732 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  22.77 
 
 		 721 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  23.08 
 
 		 793 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3524  hypothetical protein  45.45 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.59 
 
 		 348 aa  47.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.3 
 
 		 334 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 		 347 aa  44.3  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 		 338 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 348 aa  44.3  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.25 
 
 		 348 aa  43.9  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>