15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3524 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3524  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  718    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2650  hypothetical protein  31.48 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0126037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.41 
 
 		 11716 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0108  hypothetical protein  27.92 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  33.54 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  29.65 
 
 		 655 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0116  hypothetical protein  40.95 
 
 		 571 aa  52.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  28.07 
 
 		 615 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1578  hypothetical protein  31.45 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3314  hypothetical protein  32.54 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  45.45 
 
 		 627 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  56.41 
 
 		 640 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 7149 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  42.5 
 
 		 748 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  47.73 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>