74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1252 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  62.3 
 
 		 729 aa  884    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  57.06 
 
 		 720 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  55.74 
 
 		 723 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  57.48 
 
 		 721 aa  794    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  62.02 
 
 		 729 aa  877    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  70.84 
 
 		 731 aa  1023    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  62.62 
 
 		 733 aa  912    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  53.07 
 
 		 723 aa  721    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  55.25 
 
 		 719 aa  747    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 732 aa  1470    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  56.03 
 
 		 723 aa  755    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  94.81 
 
 		 732 aa  1380    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  43.15 
 
 		 754 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  43.15 
 
 		 754 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  42.39 
 
 		 760 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  41.23 
 
 		 793 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  40.06 
 
 		 776 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  39.7 
 
 		 775 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  37.06 
 
 		 423 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 1641 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 1641 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.81 
 
 		 501 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  39.67 
 
 		 498 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  24.24 
 
 		 575 aa  72  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  24.38 
 
 		 624 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  24.1 
 
 		 635 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  23.5 
 
 		 624 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  23.58 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  24.31 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.45 
 
 		 3977 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  23.3 
 
 		 624 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 600 aa  58.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  24.7 
 
 		 624 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  24.39 
 
 		 624 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  23.31 
 
 		 624 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  24.7 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  27.27 
 
 		 633 aa  55.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 2701 aa  55.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  36.84 
 
 		 1322 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  25.98 
 
 		 601 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  24.39 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  24.51 
 
 		 627 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  38 
 
 		 567 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.98 
 
 		 429 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  35.05 
 
 		 1355 aa  51.6  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  33.67 
 
 		 551 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  33.68 
 
 		 589 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.76 
 
 		 774 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  23.97 
 
 		 539 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  26.11 
 
 		 721 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  24.47 
 
 		 600 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.84 
 
 		 2852 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  26.42 
 
 		 622 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  36.13 
 
 		 576 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  31.67 
 
 		 539 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  33.68 
 
 		 589 aa  48.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 533 aa  47.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  31.03 
 
 		 598 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  25.98 
 
 		 599 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  32.1 
 
 		 621 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  31.29 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 		 1175 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  29.7 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  23.45 
 
 		 1587 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.57 
 
 		 348 aa  45.8  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  32.14 
 
 		 2182 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  29.94 
 
 		 513 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  29.7 
 
 		 513 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  25.64 
 
 		 857 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.44 
 
 		 513 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  30.95 
 
 		 453 aa  44.3  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>