70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0616 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  100 
 
 		 729 aa  1470    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  62.29 
 
 		 732 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  53.01 
 
 		 719 aa  731    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  61.58 
 
 		 732 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  63.08 
 
 		 731 aa  900    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  98.9 
 
 		 729 aa  1453    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  58.49 
 
 		 721 aa  818    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  58.62 
 
 		 723 aa  807    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  57.18 
 
 		 720 aa  813    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  59.18 
 
 		 723 aa  817    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  52.87 
 
 		 723 aa  735    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  61.7 
 
 		 733 aa  925    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  47.07 
 
 		 760 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  45.19 
 
 		 754 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  45.19 
 
 		 754 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  40.96 
 
 		 793 aa  496  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  40.82 
 
 		 776 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  38.81 
 
 		 775 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  36.66 
 
 		 423 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.53 
 
 		 1641 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 		 1641 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  25.71 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  30.43 
 
 		 624 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  30.92 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  27.8 
 
 		 624 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  27.51 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  37.6 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  26.6 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 624 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  28.02 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  27.71 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  27.5 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  27.6 
 
 		 451 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.25 
 
 		 453 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  24.8 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  28.37 
 
 		 624 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  26.04 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  25.18 
 
 		 633 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  26.18 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  27.05 
 
 		 627 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  25.74 
 
 		 539 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.79 
 
 		 2701 aa  55.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.19 
 
 		 3977 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  24.34 
 
 		 551 aa  55.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 600 aa  55.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  25.07 
 
 		 635 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  25.51 
 
 		 451 aa  52  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  25.26 
 
 		 1587 aa  51.2  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  30.66 
 
 		 457 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  23.71 
 
 		 622 aa  50.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  22.39 
 
 		 857 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  24.56 
 
 		 601 aa  48.9  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  33.09 
 
 		 1355 aa  48.9  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  47.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.27 
 
 		 318 aa  47.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.67 
 
 		 774 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  27.92 
 
 		 599 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  28.8 
 
 		 589 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.1 
 
 		 494 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  24.9 
 
 		 512 aa  45.8  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.56 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  22.51 
 
 		 1175 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.23 
 
 		 454 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  24.53 
 
 		 348 aa  44.3  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  24.79 
 
 		 387 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  27.75 
 
 		 589 aa  44.3  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  28.85 
 
 		 2182 aa  44.3  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>