71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2094 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  72.75 
 
 
451 aa  664    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  915    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  59.6 
 
 
454 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  58.31 
 
 
453 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  57.87 
 
 
453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  57.67 
 
 
457 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  36.31 
 
 
699 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  33.96 
 
 
526 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  32.21 
 
 
438 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  34.27 
 
 
470 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  30.23 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  31.43 
 
 
513 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  31.17 
 
 
513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  31.17 
 
 
513 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  30.59 
 
 
998 aa  136  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  30.91 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  34.25 
 
 
1175 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  32.97 
 
 
438 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  31.45 
 
 
1844 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.57 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  29.34 
 
 
461 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  29.17 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  27.23 
 
 
456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  29.98 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  27.44 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  28.16 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.35 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  28.23 
 
 
2852 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.1 
 
 
494 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.93 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.33 
 
 
3977 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.24 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  29.63 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  28.21 
 
 
495 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  26.48 
 
 
417 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  28.53 
 
 
495 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  30.61 
 
 
760 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.76 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.97 
 
 
501 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.68 
 
 
501 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  28.27 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  24.41 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  25.46 
 
 
945 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.69 
 
 
491 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  24.5 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.16 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  27.17 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  25.84 
 
 
457 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  27.57 
 
 
731 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.22 
 
 
769 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  25.56 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  25.51 
 
 
729 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  24.69 
 
 
719 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 
489 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  29.08 
 
 
733 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  24 
 
 
854 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  25.1 
 
 
723 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  26.48 
 
 
354 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  25.29 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  29.66 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  31.71 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  25.73 
 
 
720 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  29.37 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  25.2 
 
 
754 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  24.21 
 
 
729 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  27.08 
 
 
721 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.2 
 
 
754 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  27.03 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  27.98 
 
 
487 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  23.31 
 
 
448 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>