73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1314 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  828    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  53.85 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  42.13 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  41.89 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  40.36 
 
 		 417 aa  250  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  38.48 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  38.48 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  38.48 
 
 		 448 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  40.53 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  40.47 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  38.3 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.73 
 
 		 769 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  38.97 
 
 		 458 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  38.97 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  39.08 
 
 		 464 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.19 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  38.74 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  40.64 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  38.12 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  35.43 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  38.44 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  40.33 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  38.34 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  36.64 
 
 		 451 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  39.39 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  37.17 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  37 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  34.99 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  37.68 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  34.69 
 
 		 441 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  34.42 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.18 
 
 		 1027 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.36 
 
 		 1372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  46.55 
 
 		 208 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  30.17 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.1 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  28.29 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.53 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  29.38 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.02 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  24.19 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  25.52 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  28.64 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.19 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  28.9 
 
 		 1844 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.03 
 
 		 501 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  28.64 
 
 		 495 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.52 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.5 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  26.77 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.64 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  29.12 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.17 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.35 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  24.89 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  24.69 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  31.25 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  29.51 
 
 		 854 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  25.83 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.95 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  26.29 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  27.95 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  29.66 
 
 		 451 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  21.61 
 
 		 510 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  22.45 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  23.21 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  23.81 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  23.21 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  23.21 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  24.07 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  30.11 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  30.97 
 
 		 345 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>