59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4733 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  76.6 
 
 
451 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  80.33 
 
 
452 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  922    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  65.33 
 
 
451 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  65.03 
 
 
448 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  65.03 
 
 
448 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  68.31 
 
 
448 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  65.26 
 
 
448 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  65.32 
 
 
448 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  65.16 
 
 
451 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  63.35 
 
 
451 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  63.15 
 
 
451 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  64.68 
 
 
458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  64.44 
 
 
458 aa  571  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  63.47 
 
 
452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  59.86 
 
 
473 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  57.27 
 
 
464 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  54.59 
 
 
454 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  54.46 
 
 
452 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  48.32 
 
 
441 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  48.32 
 
 
441 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  53.09 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  51.72 
 
 
452 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  48.97 
 
 
451 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  39.33 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  35.79 
 
 
457 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  35.79 
 
 
457 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  40.53 
 
 
415 aa  226  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  35.86 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.99 
 
 
769 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  47.43 
 
 
208 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  30.94 
 
 
487 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.57 
 
 
1027 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.02 
 
 
1372 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  26.71 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.84 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.75 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.92 
 
 
486 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.8 
 
 
504 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.63 
 
 
494 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.52 
 
 
1844 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  24.06 
 
 
429 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.67 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.74 
 
 
510 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  25.67 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  23.83 
 
 
495 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  27.24 
 
 
470 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  24.16 
 
 
525 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  23.34 
 
 
495 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  30 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  25.25 
 
 
469 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  24.52 
 
 
490 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  23.6 
 
 
512 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  25.51 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  24 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.5 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  23.24 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  25.41 
 
 
515 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>