76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1224 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  972    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  57.68 
 
 
513 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  57.24 
 
 
513 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  57.02 
 
 
513 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  57.14 
 
 
513 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  51.31 
 
 
461 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  47.89 
 
 
456 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  43.52 
 
 
438 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  39.57 
 
 
429 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.7 
 
 
512 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  30.13 
 
 
1175 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  28.12 
 
 
470 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.55 
 
 
1844 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.31 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  26.72 
 
 
998 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  28.64 
 
 
457 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  29.17 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  29.79 
 
 
454 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  28.69 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  27.41 
 
 
699 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  29.52 
 
 
453 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  30.03 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  26.46 
 
 
510 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  32.19 
 
 
469 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  32.78 
 
 
945 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  27.17 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.43 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  30.24 
 
 
854 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.87 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  27.83 
 
 
504 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.29 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.29 
 
 
501 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.09 
 
 
3977 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  23.78 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  27.24 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  29 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  29.26 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  26.67 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  26.18 
 
 
2852 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  28.29 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  25.18 
 
 
448 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  25.09 
 
 
448 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  25.09 
 
 
448 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  24.55 
 
 
448 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  24.27 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  24.92 
 
 
495 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  23.6 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  23.48 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  29.56 
 
 
451 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.94 
 
 
769 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  25.24 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  27.46 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  23.99 
 
 
495 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  25.73 
 
 
491 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  25.83 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  24.1 
 
 
451 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  27.32 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  23.62 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  23.57 
 
 
458 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.58 
 
 
441 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  25.93 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  26.58 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  25.13 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  22.22 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  22.86 
 
 
458 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  22.56 
 
 
448 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  24 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  28.18 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  23.33 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  21.9 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.84 
 
 
1027 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  26.35 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  36.14 
 
 
348 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  25 
 
 
473 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>