59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2450 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  937    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  65.56 
 
 
456 aa  620  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  53.44 
 
 
513 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  53.21 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  52.75 
 
 
513 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  52.98 
 
 
513 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  51.31 
 
 
472 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  40.71 
 
 
429 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  37.61 
 
 
438 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  33.33 
 
 
512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  29.38 
 
 
1175 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  30.48 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  30.57 
 
 
457 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  29.8 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  30.51 
 
 
451 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.67 
 
 
1844 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  30.02 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  30.29 
 
 
453 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  28.78 
 
 
510 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  28.44 
 
 
453 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.29 
 
 
438 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  26.7 
 
 
998 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  27.46 
 
 
699 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  36.52 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  28.52 
 
 
945 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  27.03 
 
 
526 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  28.8 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  28.8 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.15 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.71 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  32.42 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.05 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  26.54 
 
 
854 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
2852 aa  70.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  27.03 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.67 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.77 
 
 
3977 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 
489 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.97 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  26.32 
 
 
515 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  22.61 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
1016 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.42 
 
 
769 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  24.41 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  24.89 
 
 
390 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  26.32 
 
 
495 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  27.13 
 
 
457 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  27.13 
 
 
457 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.79 
 
 
495 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  23.35 
 
 
454 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  26.99 
 
 
733 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  29.82 
 
 
490 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  22.45 
 
 
415 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  28.26 
 
 
487 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  25.35 
 
 
451 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  25.69 
 
 
451 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  31.82 
 
 
401 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.84 
 
 
1027 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>