95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6147 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  76.36 
 
 		 504 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1002    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  57.86 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  49.04 
 
 		 466 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  36.82 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  36.03 
 
 		 501 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  36.03 
 
 		 501 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  30.08 
 
 		 515 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  35.42 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  27.25 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  34.07 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  30.31 
 
 		 854 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.51 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  28.61 
 
 		 495 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  28.41 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  28.71 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  29.05 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.46 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  29.6 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  34.21 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  27.05 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  28.64 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  28.47 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  28.15 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  30.21 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  28.19 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  30.21 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  30.21 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  29.69 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  29.84 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  27.14 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  25.74 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  28.11 
 
 		 1844 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.24 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  26.92 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  28.82 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  28.24 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 1016 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  27.34 
 
 		 384 aa  67  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  28.12 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  29.34 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  25.89 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  27.08 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  27.8 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  27.76 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  26.71 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  27.49 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.41 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  28.02 
 
 		 354 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  27.35 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.93 
 
 		 1175 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  27.1 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  29.28 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  26.73 
 
 		 419 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  25.72 
 
 		 998 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  25.07 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  29.22 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  26.94 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  25.91 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  27 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  24.32 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  25.63 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  29.26 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 3977 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  26.44 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  24.65 
 
 		 699 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  27.56 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  26.58 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.56 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  26.58 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  28.71 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  28.71 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  28.71 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  27.14 
 
 		 451 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  26.54 
 
 		 452 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  28.3 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  28.45 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  26.89 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  26.76 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  24.31 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  26.34 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  26.89 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  26.33 
 
 		 945 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  27.46 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  26.1 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  29.61 
 
 		 2852 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  26.3 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  28.65 
 
 		 452 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  27.48 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  23.68 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.81 
 
 		 769 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  25.88 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  29.94 
 
 		 390 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>