44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2228 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1386    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  50.8 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  34.86 
 
 		 453 aa  218  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  35 
 
 		 453 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  34.94 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  36.33 
 
 		 451 aa  211  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  34.99 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  34.47 
 
 		 457 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  31.17 
 
 		 438 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  30.55 
 
 		 438 aa  127  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  27.96 
 
 		 998 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  30.63 
 
 		 429 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.99 
 
 		 1844 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  30.08 
 
 		 470 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  28.61 
 
 		 1175 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  27.41 
 
 		 472 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  27.4 
 
 		 513 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  27.17 
 
 		 513 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  27.74 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  26.88 
 
 		 513 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  27.11 
 
 		 513 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  31 
 
 		 512 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  27.23 
 
 		 461 aa  100  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.46 
 
 		 11716 aa  93.2  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 3977 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  28.33 
 
 		 945 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2650  hypothetical protein  31.42 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0126037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.63 
 
 		 2852 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  37.8 
 
 		 655 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0108  hypothetical protein  37.29 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1578  hypothetical protein  40.17 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  24.42 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  25.99 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  26.12 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  25.23 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  25.74 
 
 		 504 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.55 
 
 		 494 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3524  hypothetical protein  32.45 
 
 		 370 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3314  hypothetical protein  29.49 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  26.3 
 
 		 390 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.81 
 
 		 466 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  24.44 
 
 		 469 aa  45.8  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>