10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0108 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3314  hypothetical protein  35.14 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  42.96 
 
 		 655 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2650  hypothetical protein  38.79 
 
 		 496 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0126037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  32.45 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.18 
 
 		 11716 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1578  hypothetical protein  28.88 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  37.29 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001966  chromosome segregation ATPase  26.4 
 
 		 490 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1096  hypothetical protein  26.95 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>