94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4951 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  876    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  60.53 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  44.09 
 
 		 513 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  44.09 
 
 		 513 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  43.84 
 
 		 513 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  43.6 
 
 		 513 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  43.52 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  38.34 
 
 		 456 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  37.61 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  42.12 
 
 		 512 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  33.76 
 
 		 998 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  33.99 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  35.8 
 
 		 1844 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  32.21 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  33.89 
 
 		 1175 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  32.94 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  32.86 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  31.38 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  30.77 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  29.45 
 
 		 510 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  32.16 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  31.17 
 
 		 699 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  31.38 
 
 		 945 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  31.18 
 
 		 526 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  35.86 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  35.42 
 
 		 494 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  36.36 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  33.44 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  32.49 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  33.58 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 854 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  28.67 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.81 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  35.83 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  25.43 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.91 
 
 		 515 aa  89.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  32.22 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  32.22 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  27.76 
 
 		 495 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.26 
 
 		 3977 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.66 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  29.44 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  25.07 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  26.74 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  24.48 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  28.96 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  28.28 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  28.28 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  28.02 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  26.42 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  28.43 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  26.79 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  28.46 
 
 		 2852 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  28.72 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 1016 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  22.65 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.91 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  28.84 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  29.17 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  28.72 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  28.72 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  28.72 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  30.49 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  28.09 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  26.76 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  28.43 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  25.51 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  26.05 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  27.14 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  26.53 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  29.06 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  24.87 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  27.54 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 657 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  25.12 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  27.72 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  27.38 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  27.65 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  28.27 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  26.2 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.93 
 
 		 1027 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  28.76 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  37.66 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  26.46 
 
 		 719 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  31.21 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  26.76 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  23.81 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.28 
 
 		 732 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.86 
 
 		 1372 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  26.82 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  25.43 
 
 		 733 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>