80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5253 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  66.84 
 
 
410 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  66.84 
 
 
410 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.45 
 
 
1016 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  48.75 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  52.11 
 
 
1844 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  47.34 
 
 
394 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  40.82 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  45.88 
 
 
390 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  41.87 
 
 
387 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  38.23 
 
 
376 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  43.87 
 
 
383 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.87 
 
 
383 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  36.67 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  35.83 
 
 
379 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  37.16 
 
 
354 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  38.57 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  35.62 
 
 
388 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  33.61 
 
 
381 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.22 
 
 
389 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  32.5 
 
 
345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  32.35 
 
 
404 aa  158  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  32.08 
 
 
404 aa  156  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  31.89 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  28.65 
 
 
401 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.63 
 
 
494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.02 
 
 
501 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  29.86 
 
 
344 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.02 
 
 
501 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.89 
 
 
657 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.15 
 
 
494 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.45 
 
 
504 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.78 
 
 
469 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.65 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.06 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.92 
 
 
515 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  28.76 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  26.22 
 
 
429 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.27 
 
 
512 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  24.15 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5254  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.9 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  23.87 
 
 
513 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  23.85 
 
 
513 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  23.94 
 
 
513 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  23.56 
 
 
513 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2726  hypothetical protein  63.64 
 
 
243 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4419  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.86 
 
 
229 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2725  hypothetical protein  63.64 
 
 
239 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2724  hypothetical protein  63.64 
 
 
243 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  24.75 
 
 
456 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2723  hypothetical protein  50.85 
 
 
301 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2173  hypothetical protein  70.97 
 
 
299 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2235  hypothetical protein  70.97 
 
 
278 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3228  hypothetical protein  64.52 
 
 
209 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0556  protein of unknown function DUF1555  71.43 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  72.41 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4130  C-type lectin domain protein  66.67 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4091  C-type lectin domain protein  66.67 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  27.33 
 
 
358 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 
489 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5137  hypothetical protein  60 
 
 
219 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000391037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4063  hypothetical protein  55 
 
 
195 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  59.38 
 
 
377 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2180  hypothetical protein  56.76 
 
 
242 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  27.46 
 
 
384 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  23.14 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1700  hypothetical protein  66.67 
 
 
193 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  25.91 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 
854 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1682  hypothetical protein  66.67 
 
 
172 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  26.13 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0490  hypothetical protein  54.84 
 
 
193 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  25.91 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1527  hypothetical protein  63.64 
 
 
237 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4922  hypothetical protein  47.73 
 
 
173 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1528  hypothetical protein  61.11 
 
 
241 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1806  hypothetical protein  66.67 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.42 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0270  hypothetical protein  58.06 
 
 
194 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  22.82 
 
 
495 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>