38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0487 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  781    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  57.41 
 
 
384 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  42.9 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  43.35 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  40.06 
 
 
354 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.92 
 
 
1016 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  36.87 
 
 
389 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  37.19 
 
 
410 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  34.73 
 
 
399 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  37.19 
 
 
410 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  35.34 
 
 
419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  35.49 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  34.48 
 
 
1844 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  32.77 
 
 
376 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  35.11 
 
 
381 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  30.99 
 
 
394 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  30.75 
 
 
396 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  33.43 
 
 
404 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  33.43 
 
 
404 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  30.26 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  31.19 
 
 
401 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  30.28 
 
 
387 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  30.19 
 
 
390 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  28.83 
 
 
383 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  31.44 
 
 
344 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.12 
 
 
494 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.17 
 
 
501 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.84 
 
 
501 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  26.42 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.04 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.9 
 
 
504 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  26.19 
 
 
998 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  24.71 
 
 
469 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.03 
 
 
466 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  23.26 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  25.31 
 
 
297 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  24.14 
 
 
1175 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>