45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1424 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  807    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  40.37 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  38.79 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  38.79 
 
 
410 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  36.46 
 
 
354 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.75 
 
 
1016 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  33.61 
 
 
384 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  33.6 
 
 
376 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  32.79 
 
 
379 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  31.9 
 
 
394 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  33.16 
 
 
396 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.1 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  35.23 
 
 
388 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  36.52 
 
 
1844 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  34.95 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  31.25 
 
 
381 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  32.98 
 
 
404 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  32.44 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  34.15 
 
 
384 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  30.85 
 
 
387 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  33.06 
 
 
345 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  29.38 
 
 
383 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.14 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  27.68 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  28.82 
 
 
344 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  26.98 
 
 
401 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  26.79 
 
 
501 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.79 
 
 
501 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  29.9 
 
 
494 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.78 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  31.34 
 
 
466 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  27.87 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.98 
 
 
438 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  26.44 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.92 
 
 
504 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27 
 
 
494 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.5 
 
 
657 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.61 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.58 
 
 
515 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  23.08 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.84 
 
 
854 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  25.55 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
489 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  25.88 
 
 
510 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  29.87 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>