37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7563 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  66.77 
 
 
359 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  64.72 
 
 
332 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  61.9 
 
 
384 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  65.1 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  62.09 
 
 
382 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  62.04 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  40.69 
 
 
345 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  42.43 
 
 
341 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  41.9 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  36.86 
 
 
340 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  35.74 
 
 
339 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  34.64 
 
 
330 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  38.16 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  35.56 
 
 
352 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  33.88 
 
 
318 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  32.86 
 
 
308 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  31.43 
 
 
283 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  30.74 
 
 
322 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  30.82 
 
 
297 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  30.82 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  28.06 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  30.82 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  27.48 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  25.47 
 
 
394 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  24.1 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.96 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  27.03 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  27.22 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  32.04 
 
 
389 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  23.91 
 
 
354 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  27 
 
 
410 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  27.3 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  26.09 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2552  lipoprotein  27.97 
 
 
318 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  34.86 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  34.86 
 
 
404 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>