39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2281 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  32.14 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  29.66 
 
 
384 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  34.36 
 
 
345 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  32.2 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  28.88 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  35.17 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.42 
 
 
1016 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  30.35 
 
 
384 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  31.59 
 
 
404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  28.53 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  28.82 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  31.99 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  31.44 
 
 
388 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  31.01 
 
 
404 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  26.3 
 
 
376 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  30.06 
 
 
419 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  28.88 
 
 
410 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  28.88 
 
 
410 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  27.84 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  31.59 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  26.38 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  25.65 
 
 
1844 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  26.89 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  28.14 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27.8 
 
 
494 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.29 
 
 
504 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.11 
 
 
657 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  30 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  26.77 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.23 
 
 
470 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  25.86 
 
 
513 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  26.71 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  24.71 
 
 
513 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  26.8 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  25.86 
 
 
513 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.62 
 
 
466 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25.36 
 
 
494 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>