27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08866 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  730    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  34.49 
 
 
376 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  30.43 
 
 
404 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  30.43 
 
 
404 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  31.28 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  29.51 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  26.39 
 
 
389 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  32.32 
 
 
419 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  29.97 
 
 
384 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  33.88 
 
 
410 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  33.7 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  32.53 
 
 
354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  30.67 
 
 
394 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  27.68 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  25.47 
 
 
401 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
1016 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  28.03 
 
 
384 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  29.13 
 
 
345 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  31 
 
 
396 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  28.45 
 
 
379 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  30.81 
 
 
390 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  29.35 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  30.25 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.89 
 
 
1844 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  26.38 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  24.72 
 
 
494 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>