50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2888 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  712    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  46.69 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  45.48 
 
 
384 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.11 
 
 
1016 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  40.93 
 
 
1844 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  39.5 
 
 
394 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  40.06 
 
 
388 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  36.46 
 
 
399 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  38.73 
 
 
396 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  39.18 
 
 
384 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  37.89 
 
 
410 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  37.78 
 
 
410 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  37.22 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  36.42 
 
 
381 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.97 
 
 
389 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  34.58 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  35.54 
 
 
390 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  34.29 
 
 
404 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  34.94 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  31.37 
 
 
376 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  33.73 
 
 
387 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  34.4 
 
 
401 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.16 
 
 
383 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  35.16 
 
 
383 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  28.88 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  32.53 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
657 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.12 
 
 
501 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.99 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25.82 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.94 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.68 
 
 
469 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.02 
 
 
494 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  31.98 
 
 
470 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  28.27 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.53 
 
 
504 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  26.27 
 
 
359 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.64 
 
 
466 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  26.48 
 
 
451 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  27.44 
 
 
515 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  24.29 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  26.34 
 
 
512 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  23.91 
 
 
358 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  26.43 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.19 
 
 
438 aa  46.2  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  31.98 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  26.3 
 
 
448 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  26.3 
 
 
448 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  26.3 
 
 
448 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.32 
 
 
318 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>