36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3038 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  782    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.19 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  56.44 
 
 		 383 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  50 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  38.79 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  41.87 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  37.95 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  37.95 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  37.73 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 1016 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  38.44 
 
 		 1844 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  34.96 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  30.64 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  35.24 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  31.85 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  33.73 
 
 		 354 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  32.77 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  29.37 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  29.97 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  30.28 
 
 		 388 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  31.53 
 
 		 381 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  29.53 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  28.97 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  27.57 
 
 		 401 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  29.27 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  26.89 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  23.04 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  22.81 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25.74 
 
 		 494 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  24.12 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.22 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  24.79 
 
 		 729 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  24.23 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  23.78 
 
 		 723 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  24.93 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>