46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2778 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  99.26 
 
 		 404 aa  790    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  796    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  63.66 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  54.1 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  45.63 
 
 		 401 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  34.73 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  39.03 
 
 		 345 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  34.13 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  31.28 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  31.51 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  34.09 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  31.48 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  33.15 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  34.49 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  33.61 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  32.63 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  34.22 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.13 
 
 		 1016 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  31.51 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.75 
 
 		 1844 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  30.51 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  29.81 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  31.64 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  29.37 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.3 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.03 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.91 
 
 		 504 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  27.44 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.18 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  23.34 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  27.48 
 
 		 330 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.65 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.71 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.71 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.95 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  35.78 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  34.86 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  33.94 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.69 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  33.62 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  33.98 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  25.79 
 
 		 515 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  22.65 
 
 		 1175 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>