15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4474 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.29 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.71 
 
 		 657 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  26.79 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  27.48 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  27.25 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  23.63 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  26.09 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  27.15 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  23.08 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.91 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 		 1016 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  22.07 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  23.87 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  26.59 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>