27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0541 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  69.6 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  71.88 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  71.25 
 
 		 382 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  64.72 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  67.37 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  61.26 
 
 		 356 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  43.87 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  40.14 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  38.24 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  40.98 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  37.27 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  39.94 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  37.74 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  33 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  35.32 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  35.32 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  32.59 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  31.41 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  31 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  31.73 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  29.62 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  31.76 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  26.38 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.27 
 
 		 1016 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  33.98 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  24.92 
 
 		 384 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>