25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0032 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  98.59 
 
 
283 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  73.06 
 
 
297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  52.99 
 
 
322 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  48.49 
 
 
293 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  38.29 
 
 
308 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  35.32 
 
 
332 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  31.75 
 
 
384 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  34.2 
 
 
359 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
330 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  29.52 
 
 
345 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  31.18 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  30.82 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  31.34 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  28.53 
 
 
340 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  31.23 
 
 
339 aa  89.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  31.8 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  29.63 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.99 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  31.67 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  29.17 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  27.18 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  25.98 
 
 
384 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  30.39 
 
 
332 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>