25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1879 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  47.74 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  44.51 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  42.3 
 
 		 382 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  43.87 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  42.43 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  43.17 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  40.45 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  34.04 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  35.71 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  35.18 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  36.09 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  35.67 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  34.38 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  29.93 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  30.22 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  29.17 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  31.11 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  30.35 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  28.99 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  30.62 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  28.2 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  26.6 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  28.42 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  30.3 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>