26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0500 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  79.15 
 
 		 356 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  68.04 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  67.47 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  65.1 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  67.3 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  62.18 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  43.17 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  42.86 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  43.46 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  40.63 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  38.06 
 
 		 339 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  37.46 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  36.94 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  32.56 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  32.39 
 
 		 352 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  30.74 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  30.74 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  29.47 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  28.04 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  29.63 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  30.38 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  27.31 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  25.43 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  34.26 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  34.26 
 
 		 404 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>