24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4044 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  681    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  52 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  53.7 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  50.17 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  47.59 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  41.9 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  43.46 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  40.98 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  39.27 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  39.29 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  40.98 
 
 		 356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  38.89 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  42.01 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  36.93 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  32.86 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  30.9 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  30.63 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  31.74 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  31.18 
 
 		 283 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  31.18 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  28.26 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  28.47 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>