24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3339 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  51.32 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  47.65 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  49.26 
 
 		 322 aa  221  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  48.07 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  39.01 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  33.11 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  31.74 
 
 		 339 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  29.12 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  29.47 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  30.92 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  28.67 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  29.62 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  29.62 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  28.06 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  29.31 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  26.6 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  26.86 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  27.41 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  25.87 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  30.86 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  27.52 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  26.57 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.51 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>