29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0285 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  79.49 
 
 		 384 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  78.05 
 
 		 382 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  69.7 
 
 		 332 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  64 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0500  hypothetical protein  64.47 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0405  hypothetical protein  56.98 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1879  hypothetical protein  47.74 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.237366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3882  hypothetical protein  39.37 
 
 		 345 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0183166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3589  hypothetical protein  39.09 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3072  hypothetical protein  38.02 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4044  hypothetical protein  37.64 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.948145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2558  putative signal peptide protein  36.93 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290858  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1708  hypothetical protein  37.26 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  34.81 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  34.2 
 
 		 283 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  34.2 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2327  hypothetical protein  31.51 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519854  normal  0.378191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  29.74 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  32.21 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  29.96 
 
 		 297 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3339  hypothetical protein  29.12 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4143  hypothetical protein  29.33 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.980511  normal  0.981417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2751  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  26.27 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 		 1016 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  26.38 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  28.19 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  26.95 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>